Carteira de servizos do Servizo de Microbioloxía e Parasitoloxía
CARTERA DE SERVICIOS DE LA ACTIVIDAD URGENTE Técnicas rápidas Examen directo de muestras clínicas/ Tinción de Calcofluor Tinción de Gram. Tinción de BAAR. Diagnóstico en sangre periférica de paludismo. Tinción de Giemsa/ IC. Tinción de tinta china en LCR para diagnóstico de Cryptococcus neoformans Detección de antígeno de Streptococcus pneumoniae en orina y líquidos estériles. IC. Detección de antígeno de Legionella pneumophila serotipo1 en orina. IC. Detección de antígeno de Virus Respiratorio Sincitíal, Metapneumovirus/virus de la influenza A y B en muestras respiratorias. IC/IF/TPX. Detección de la toxina A y B de Clostridium difficile en heces .IC. Detección de antígenos de Rotavirus, Adenovirus y Astrovirus en heces. IC. Detección cualitativa en sangre de anticuerpos frente al VIH 1 y VIH 2. IC. Detección de Pneumocystis jiroveci en esputo inducido y lavado broncoaveolar. IF. Detección de antígenos bacterianos en líquidos cefalorraquídeos. PCR en T real del complejo Mycobacterium tuberculosis PCR en T real de enterovirus y herpervirus en LCR. Procesamiento de muestras Se procesaran las siguientes muestras: Líquidos estériles (LCR, ascítico, pleural, articular, pericárdico, intraocular etc.) Biopsias de tejidos, abscesos, material obtenido por punción aspiración con aguja fina (PAAF) y muestras invasivas. Muestras obtenidas por broncoscopia. Hemocultivos que se positivizan en horario de guardia. Muestras procedentes de pacientes inmunodeprimidos (Hematología, Oncología, Infecciosos, etc.) y de unidades de críticos. Solicitudes con carácter urgente y pactadas con el facultativo de guardia. Todas aquellas muestras, no incluidas en los apartados anteriores, que por razones de viabilidad exigen la siembra de forma inmediata. Realización de informes Preliminares, mediante comunicación verbal con los clínicos de guardia e inclusión del informe en el IANUS, cuando lo considere relevante el FEAS de guardia. Validación de informes definitivos, cuando lo considere pertinente el FEAS de guardia. CARTERA DE SERVICIOS DE LA ACTIVIDAD ORDINARIA BACTERIOLOGÍA Las diferentes técnicas están destinadas a la detección e identificación protocolizada precisa y rápida de bacterias en muestras clínicas. Examen en fresco de productos biológicos. Tinciones: Gram, naranja de acridina y otras Hemocultivo convencional y lísis centrifugación (Isolator) Cultivo de catéteres IV -cuantitativo-Maki-, cultivo de catéteres y otros dispositivos intravasculares Cultivo de derivaciones de Sistema Nervioso Central Cultivo de material protésico Cultivo de muestras procedentes de cirugía abdominal, cardíaca, torácica, traumatológica, neurológica, ORL, vascular y otros Cultivo de fluidos biológicos estériles: LCR, ascítico, sinovial, pericárdico, pleural y otros Cultivo muestras oftalmológicas Diagnóstico infecciones ORT: óticas, sinusales, nasales y cultivo de exudado faríngeo Diagnóstico de tosferina por cultivo Diagnóstico de infecciones del tracto respiratorio inferior: cultivo selectivo de esputo y broncoaspirado, cultivo cuantitativo de catéter telescopado y lavado broncoalveolar, cultivo de cánulas y tubos endotraqueales. Cultivo cuantitativo en esputo en pacientes con fibrosis quística Cultivo e identificación de Legionella pneumophila Estudio de biopsias. Microbiología de la piel, tejido celular subcutáneo, óseo y punciones con aguja fina Cultivo de Helicobacter pylori Coprocultivo convencional (incluyendo detección de Yersinia, especies de enteropatógenos, Vibrio spp, Aeromonas spp) Cultivo e identificación de bacilos Gramnegativos aerobios y aerobios facultativos a nivel de especie Cultivo e Identificación de Staphylococcus spp Cultivo e identificación de Streptococcus spp Cultivo e Identificación de Corynebacterium spp Cultivo e Identificación de Listeria spp Cultivo e Identificación Bacillus spp. Cultivo e Identificación de Actinomicetos aerobios Cultivo e identificación de bacterias anaerobias Identificación de especies bacterianas mediante detección de proteínas- espectrometría de masas- sistema MALDI-TOF Tipificación bacteriana DETECCIÓN DE ADN/ANTÍGENOS BACTERIANOS EN MUESTRAS CLÍNICAS Detección de ADN bacteriano en sangre, otros líquidos estériles y biopsias por PCR múltiplex a tiempo real Detección de ADN por PCR en tiempo real Mycoplasma pneumoniae Detección de ADN por PCR en tiempo real Bordetella pertussis y Bordetella parapertussis Detección de antígenos bacterianos en LCR y otros líquidos estériles Detección de antígeno de Legionella pneumophila (Muestras de orina mediante IC) Detección de antígeno de Streptococcus pneumoniae en orina mediante IC Detección de antígeno de Streptococcus pyogenes en exudados faríngeo Detección de antígeno de Helicobacter pylori en heces mediante EIA Detección de antígeno y toxinas A y B de Clostridium difficile mediante IC PRUEBAS DE SUSCEPTIBILIDAD BACTERIANA A ANTIMICROBIANOS Técnica mediante difusión Kirby -Bauer y otros protocolos Técnica mediante difusión de E-test Sistemas automatizados de determinación de CMI Detección rápida de la resistencia a la meticilina en S. aureus Detección de beta-lactamasas, plasmídica y cromosómica y semicaracterización Detección de carbapenemasas y semicaracterización Estudios de sinergia antibiótica. CONTROL MICROBIOLÓGICO EN RELACIÓN AL AMBIENTE Y A LA INFECCION ASOCIADA A LA ASISTENCIA SANITARIA En esta sección, se estudian los principales parámetros de propagación de las infecciones intrahospitalarias y su posible control. Estudio de portadores nasofaríngeo: Neisseria meningitidis, Haemophilus sp., Streptococcus pneumoniae y Staphylococcus aureus. Control bacteriológico de portadores en personal laboral Control de colonización/infección de BMR Control microbiológico de esterilización en hornos Pasteur, autoclaves y sistemas por óxido de etileno Control microbiológico de la contaminación de preparaciones procedentes del Servicio de Farmacia (nutriciones parenterales, soluciones antisépticas, fármacos preparados para trasfundir/antitumorales) Control microbiológico de bolsas de transfusión y hemoderivados procedentes del Servicio de Hematología y del Centro de Trasfusiones de Galicia Control microbiológico de muestras procedentes del banco de huesos Control microbiológico de muestras de leche de biberonería y otras procedentes del Servicio de Pediatría Control microbiológico del agua de diálisis procedente del Servicio de Nefrología Control microbiológico de las cabinas de flujo del Servicio de Hematología Control microbiológico del aire en quirófanos y unidades de riesgo Control microbiológico de superficies, aparatos, respiradores y fómites, en unidades de alto riesgo de infección relacionada con el sistema sanitario Tipificación molecular de cepas bacterianas en relación a la infección hospitalaria MICOBACTERIOLOGÍA En la unidad funcional de Micobacterias del Servicio de Microbiología de la XXIS, está integrado el Laboratorio de Referencia de Micobacterias de Galicia (LRMG). Tinciones de ácido alcohol-resistencia en directo y/o previa concentración de la muestra según protocolos Amplificación de ADN/ARN del complejo Mycobacterium tuberculosis mediante PCR en tiempo real Detección mediante técnicas de PCR de genes de resistencia Cultivo en medio líquido y sólido del complejo Mycobacterium tuberculosis de muestras estériles y no estériles Cultivo de micobacterias no tuberculosas (MNT) en medios líquidos automatizados y sólidos, de muestras estériles y muestras no estériles Identificación bioquímica de Mycobacterium spp Identificación genotípica de M.tuberculosis/ M.bovis/ M. bovis BCG/ M. africanum Identificación genotípica de especies de Mycobacterium spp Antibiograma de 1ª línea : isoniazida, rifampicina, etambutol y pirazinamida Antibiohgrama de 2ª línea: estreptomicina, capreomicina, amikacina, etionamida, ofloxacina y PAS Tipificación molecular de cepas por técnica RFLP/ rep PCR Detección de IGRA (IFN-γ release assays) para diagnóstico de la infección tuberculosa MICOLOGÍA Examen en fresco de las muestras con KOH-glicerol-fucsina ácida y calcofluor y montaje de colonias fúngicas para identificación y microcultivo Examen de muestras de LCR con tinta china IFI para detección de Pneumocystis jirovecii en esputo inducido y/o lavado broncoalveolar Cultivo e identificación de hongos levaduriformes Cultivo e identificación de hongos filamentoso de micosis profundas Cultivo e identificación de dermatofitos Identificación de especies fúngicas mediante detección de proteínas- espectrometría de masas- sistema MALDI-TOF Antifungigrama de levaduras Antifungigrama de hongos filamentosos Detección de antígeno de Criptococcus neoformans en suero y LCR Detección de ADN fúngico mediante PCR en t-real multiplex en sangre, detectando A.fumigatus, C.albicans, C.parapsilosis, C.krusei, C.tropicalis y C.glabrata. Detección de antígeno manano de Candida albicans en suero Detección de antígeno galactomanano de Aspergillus spp. PARASITOLOGIA Examen en fresco de muestras (vaginales, jugo duodenal, abscesos, etc) Tinción tricrómica de Gomori (heces, abscesos hepáticos, etc) Tinciones Roamowsky y/o modificaciones en sangre, medula osea y tejidos. Tinción de Giemsa y/o modificaciones en sangre, médula osea y tejidos. Detección de coccidios por tinción de auramina-fenol. Estudio de parásitos en heces: técnica de concentración de Ritchie, flotación y Kato. Tinción mediante IFD de Giardia spp y Cryptosporidium spp. Estudio de hemoparásitos. Inmunocromatografía de Plasmodium spp/ P.falciparum. Estudio de parásitos en orina y otros líquidos orgánicos. Cultivo e identificación de Amebas de vida libre en raspados corneales, lentillas, etc. Cultivo de Leishmania spp. Detección de Ag en orina de Leishmania spp. Detección de Enterobius spp. por la técnica de Graham. Detección de viabilidad de Echinococcus spp. en quistes. Identificación morfológica de helmintos intestinales. Cultivo de larvas de nematodos. Identificación de larvas y formas adultas de especies en casos de miasis. Identificación morfológica de artrópodos de interés médico. INMUNOLOGIA BACTERIANA, FUNGICA Y PARASITARIA Brucella spp. Ac totales (test de Coombs. Rosa de Bengala). LUES (Treponema palidum). RPR (AL), IgM (ELISA), FTA (IFI) y VDRL. Legionella pneumophila. IgG/IgM (IF). Mycoplama pneumoniae. IgG/ IgM (EIA). Chlamydophila pneumoniae. Ig G/ IgM (EIA). Chlamydophila psitacci. IgG/ IgM (IFI) Coxiella burnetti. IgG/ IgM (IFI). Fases I y II Ricketsia conorii. IgG/ IgM (IFI). Borrelia spp .Ac totales (SV). IgG/IgM (EIA).Inmunoblot G/M Helicobacter Ig G (EIA) Candida albicans. Ac antimicelio (IFI). Detección mediante IP de anticuerpos en suero frente a antígenos de Aspergillus fumigatus. Toxoplasma gondii.Ig M (ELFA) - Ig G (ELFA). Toxoplasmosis avidez. Entamoeba spp.Ac totales (IFI) Leishmania spp. Ac totales (IFI) Plasmodium spp. Ac totales (IFI) Hidatidosis. Ac totales. (EIA) Leptospira (HA/ IFI) Para llevar a cabo dichos estudios la sección de serología cuenta con las siguientes técnicas: IF Inmunofloorescencia IFI Inmunofluorescencia indirecta EIA Enzimoinmunoensayo AL Aglutinación con Latex HA Hemaglutinación/SV sistema Vidas F Floculación IB Inmunoblot IP Inmunoprecipitación. VIROLOGIA Virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH): Detección de antigeno/anticuerpo (QL), Confirmación (EID y/o WB), Carga viral (RT-PCR tr). Genotipado Viral y proviral para estudio de resistencias en Retrotranscriptasa, Proteasa, Integrasa, gp41 y gp120 por SEQ. Estudio de tropismo viral y proviral por SEQ. Subtipado viral por SEQ y Filogenia. Prueba rápida (IC) Virus de la Inmunodeficiencia Humana tipo2 (VIH2): Detección de antigeno/anticuerpo (QL), Confirmación (EID y/o WB). Prueba rápida (IC). Virus linfotrópico humano tipo 1: Detección de anticuerpos (QL), Confirmación (EID). Detección proviral. Virus linfotrópico humano tipo 2: Detección de anticuerpos (QL), Confirmación (EID). Detección proviral. Citomegalovirus [CMV] : Detección genotípica : PCR t-real. IgG/IgM (EIA) Virus Herpes Simplex (VHS1 y VHS2). Ag-IF. Detección genómica: PCR t-real. Ac IgG/IgM (QL) Virus Varicela Zoster (VVZ): Ag-IF. Detección genómica: PCR. Ac IgG/IgM Virus Herpes Humano tipo 6.(VHH 6). Detección genómica: PCR Virus de Epstein-Barr [EBV]: Detección genómica: PCR t-real. Ac VCA-IgG, VCA-IgM y EBNA IgG (QL) Adenovirus: C. convencional, Ag-IF. Ac IgG/ IgM (EIA) Virus relacionados con las gastroenteritis (Adenovirus, Rotavirus, Norovirus, Astrovirus). Ag (IC). Virus Respiratorio Sincitial (VRS): C. convencional, Shell-vial, Ag-IF, detección genómica: PCR. Virus de la Influenza A: C. convencional, Shell-vial, Ag (IF), detección genómica: PCR t real. Virus de la influenza H1N1 : detección genómica: PCR t real. Virus de la Influenza B: C. convencional, Shell-vial, Ag (IF). detección genómica: PCR. Virus Parainfluenza 1, 2, 3 C. convencional, Shell-vial, Ag (IFI). Enterovirus :C. convencional. detección genómica: PCR-real. Virus JC: Detección genómica: PCR Virus BK: Detección genómica: PCR Parvovirus B 19: Detección genómica: PCR. Ac: IgG/IgM. Virus de la Hepatitis A. Ac IgG / IgM (QL). Virus de la Hepatitis B Detección de antigenos (HBsAg y HBeAg) y anticuerpos (AntiHBc, AntiHBcIgM, AntiHBe y AntiHBs cuantitativo) (QL), Confirmación de HBsAg por neutralización (QL), Cuantificación de HBsAg (QL), Carga viral (PCR tr). Genotipado Viral para estudio de resistencias en Retrotranscriptasa y Superficie por SEQ. Genotipado viral para estudio de mutaciones en PC y PBC por SEQ. Genotipado viral por SEQ y Filogenia y también disponible por hibridación reversa en coinfecciones (LiPA). Prueba rápida (IC). Virus de la Hepatitis C, Detección de anticuerpo (QL), Confirmación (EID), Carga viral (RT-PCR tr). Ag/Ac. Genotipado Viral por hibridación reversa. Pendiente de aprobación SNPs en IL28B. Virus de la hepatitis D (delta): Detección de anticuerpos IgG/IgM (EIA), Detección del ARN-VHD (RT-PCR). Genotipado Viral por SEQ y Filogenia. Virus de la hepatitis E: Detección de anticuerpos IgG/IgM (EIA), Detección del ARN-VHE (RT-PCR). Genotipado Viral por SEQ y Filogenia. Virus del Sarampión: Cultivo convencional, Shell-vial, detección genómica:PCR. Ac IgG/IgM(EIA) Virus de la Rubéola. Ac: IgG/ IgM (QL) y dterminación de Avidez (EIA) Virus de la Parotiditis: C. convencional, Shell-vial, detección genómica: PCR t-real. Ac IgG/IgM (EIA) Dengue: Ac IgG/IgM Para llevar a cabo dichos estudios la sección de serología cuenta con las siguientes técnicas: IC inmunocromatografía IF Inmunofluorecencia QL Quimioluminiscencia EID Enzimoinmunodot PCR Técnicas de amplificación genómica: Reacción en cadena de la polimerasa Técnicas de cuantificación del nº de genomas virales (carga viral) mediante Branched DNA de Quiron incluyendo VHB, VHC y VIH Aislamiento de virus de importancia clínica en cultivos celulares en monocapa o suspensión, según métodos tradicionales y rápidas -shell-vial-. Ensayos de sensibilidad a antivirales: Sensibilidad genotípica (VIH, CMV) por secuenciación. Genotipado por hibridación con sondas específicas Genotipado por secuenciación
Se procesaran las siguientes muestras:
Las diferentes técnicas están destinadas a la detección e identificación protocolizada precisa y rápida de bacterias en muestras clínicas.
En esta sección, se estudian los principales parámetros de propagación de las infecciones intrahospitalarias y su posible control.
En la unidad funcional de Micobacterias del Servicio de Microbiología de la XXIS, está integrado el Laboratorio de Referencia de Micobacterias de Galicia (LRMG).
Para llevar a cabo dichos estudios la sección de serología cuenta con las siguientes técnicas:
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Cidadanía, Profesionais, Persoal licenciado sanitario, Investigadores/as
Oferta asistencial, Servizos sanitarios, Información sobre saúde, Formación e Docencia